É notável e merece ser visitado o interior do amplo átrio, forrado com vinte mil azulejos pictóricos da autoria de Jorge Colaço, que representam sugestivos quadros históricos e etnográficos, fazendo da Estação de São Bento uma das mais bonitas (e mais fotografadas)
Os famosos azulejos da antecâmara da Estação de São Bento foram colocados em Agosto de 1915. São cerca de 550 metros quadrados de superfície que representam cenas históricas como o casamento de D. Filipa de Lencastre com D. João I, em 1386, a conquista de Ceuta e até o Torneio de Arcos de Valdevez. É também possível encontrar cenas rurais como romarias e procissões, vindimas e feiras de gado.
O friso colorido que se encontra a toda a volta do átrio conta a história dos meios de transporte por ordem cronológica, dos primórdios até ao aparecimento do comboio.